Προκήρυξη:
Η διατριβή θα εκπονηθεί με βάση το Τμήμα Χημείας του Πανεπιστημίου Πατρών.
Τίτλος θέματος: Η σημασία των συστημάτων γλουταρεδοξίνης και θειορεδοξίνης για το βακτηριακό κύτταρο όπως προκύπτει από τη χρήση κλασσικών και σύγχρονων μεθόδων βιομοριακής ανάλυσης-υψηλής απόδοσης.
Η θέση είναι διαθέσιμη άμεσα.
Στόχοι έργου:
1. Η ταυτοποίηση των υποστρωμάτων των γλουταρεδοξινών με χρωματογραφία συγγένειας, πρωτεομική ανάλυση και σχηματισμό δικτύου αλληλεπιδράσεων (interactome). Επιλεγμένα υποστρώματα θα κλωνοποιηθούν, υπερεκφραστούν και καθαριστούν.
2. Ο χαρακτηρισμός των αλληλεπιδράσεων μεταξύ των υποστρωμάτων και των γλουταρεδοξινών με τη χρήση (i) in vitro ενζυμικών προσδιορισμών, (ii) υπολογισμών KDs (με SPR) για συγκεκριμένες αλληλεπιδράσεις, (iii) μοριακής διήθησης και (iv) κρυσταλλογραφίας ακτινών Χ.
3. Ο προσδιορισμός της συμμετοχής των συστημάτων γλουταρεδοξίνης και θειορεδοξίνης στο μεταβολισμό του κυττάρου με τη χρήση συγχρόνων μεθόδων μεταβολομικής ανάλυσης σε στελέχη εξαλείψεως συγκεκριμένων γονιδίων θειορεδοξινών και γλουταρεδοξινών.
Η μακροπρόθεσμη πρόκληση/καινοτομία αυτής της πρότασης είναι να εντοπίσει σημεία στον οξειδοαναγωγικό μεταβολισμό των βακτηρίων που θα μπορούσαν να χρησιμοποιηθούν για θεραπευτική παρέμβαση.
Το έργο χρηματοδοτείται από το ΕΛΛΗΝΙΚΟ ΙΔΡΥΜΑ ΕΡΕΥΝΑΣ ΚΑΙ ΚΑΙΝΟΤΟΜΙΑΣ, στο πλαίσιο της «2ης Προκήρυξης Ερευνητικών Έργων ΕΛ.ΙΔ.Ε.Κ. για την ενίσχυση Μελών ΔΕΠ και Ερευνητών/τριών» (Α.Π. 20741/08.01.2020) στην Επιστημονική Περιοχή Επιστήμες Ζωής (Ιατρική και Επιστήμες Υγείας).
Οι ενδιαφερόμενοι παρακαλούνται να επικοινωνήσουν με τον Επιστημονικό Υπεύθυνο του έργου (Αλέξιος Βλάμης, Επίκουρος Καθηγητής, Τμήμα Χημείας, Πανεπιστήμιο Πατρών) στο email avlamis@upatras.gr για περισσότερες πληροφορίες.