Προκήρυξη:
Αντικείμενο έργου: Η Μικροβιακή Βιοτεχνολογία αξιοποιεί μικροοργανισμούς για τη μετατροπή ανανεώσιμων πρώτων υλών σε προϊόντα προστιθέμενης αξίας. Για την ανάπτυξη ανταγωνιστικών βιοδιεργασιών που θα αντικαταστήσουν συμβατικές χημικές διεργασίες, είναι αναγκαία η χρήση εργαλείων που αναλύουν και ποσοτικοποιούν τα δυναμικά και πολύπλοκα μικροβιακά μεταβολικά δίκτυα. Η ροομίκη (fluxomics) αποτελεί την πρώτη συστημική προσέγγιση που ποσοτικοποιεί τον μεταβολικό φαινότυπο καθώς και τη δυνατότητά του να εκτελεί μια επιθυμητή βιοσυνθετική λειτουργία. Λόγω αυτού, είναι αναγκαία η εφαρμογή και αξιολόγηση μιας προηγμένης, γνωσιοκεντρικής, πολυ-ομικής τεχνολογίας, η οποία θα αναλύει μεταβολικές ροές (fluxome) στελεχών ζύμης με βιομηχανικό ενδιαφέρον (Saccharomyces cerevisiae, Yarrowia lipolytica) και θα εξορθολογεί τον μεταβολικό ανασχεδιασμό τους για αποδοτική παραγωγή ουσιών υψηλής προστιθέμενης αξίας από απόβλητα.
Στόχοι του έργου: Το έργο βασίζεται τόσο σε πειραματικές τεχνικές όσο και υπολογιστικά εργαλεία, όπως ανάλυση μεταβολικών ροών με ισοτοπική ιχνηθέτηση (13C) και προγνωστικά μοντέλα (μηχανική/βαθιά μάθηση) με χρήση δεδομένων μεταγραφωμικής (RNA-seq) για την (i) ανάλυση και ποσοτικοποίηση μεταβολικών ροών, (ii) πρόβλεψη μεταβολικoύ επαναπρογραμματισμού μετά από διαταραχές και (iii) εύρεση εναλλακτικών βελτιστοποιημένων βιοσυνθετικών μονοπατιών.
Οι κυριότερες εργασίες που θα αναλάβει ο/η υποψήφιος/α:
Δημιουργία και συλλογή:
- Φυσιολογικών (yeast physiology) και βιοενεργητικών (yeast bioenergetics) δεδομένων
- Δεδομένων ισοτοπικής ιχνηθέτησης (13C) για ανάλυση μεταβολικών ροών
- RNA-seq δεδομένων
Περιγραφή θέσης:
Τοποθεσία: Ινστιτούτο Εφαρμοσμένων Βιοεπιστημών, Εθνικό Κέντρο Έρευνας και Τεχνολογικής Ανάπτυξης, 6ο Χλμ. Χαριλάου-Θέρμη, Θεσσαλονίκη
Διάρκεια: 36 μήνες
Επιθυμητή ημερομηνία έναρξης: 1-06-2025 ή το συντομότερο δυνατόν
Μισθός: Στην περίπτωση σύμβασης εργασίας Ι.Δ.Ο.Χ,. οι μηνιαίες μεικτές αποδοχές διαμορφώνονται σύμφωνα με τις διατάξεις του Κεφαλαίου Β του Ν.4354/2015, όπως ισχύει. Στην περίπτωση σύμβασης μίσθωσης έργου έως 1.500,00€ (συμπεριλαμβανομένων όλων των εισφορών), πλέον Φ.Π.Α.
Απαραίτητα προσόντα:
- Πτυχίο Α.Ε.Ι. Βιολογίας ή Βιολογικών Εφαρμογών και Τεχνολογιών ή Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής, Βιοτεχνολογίας, Χημείας, Χημικής Μηχανικής, Φαρμακευτικής, Γεωπονίας
- Κάτοχος Μεταπτυχιακού Διπλώματος σε (Μοριακή) (Συστημική) Βιολογία, Βιοχημεία, (Συστημική) Βιοτεχνολογία, Χημική/Βιοχημική Μηχανική
- Εργαστηριακή εμπειρία σε τεχνικές μικροβιολογίας και μοριακής βιολογίας (καλλιέργεια, RT-PCR, RNA extraction, RNA seq)
- Άριστη γνώση της Αγγλικής Γλώσσας (γραπτά και προφορικά)
Επιθυμητά προσόντα:
- Γνώση Συστημικής Βιολογίας/Βιοτεχνολογίας
- Γνώση κυτταρικού μεταβολισμού
- Εμπειρία στη συλλογή ομικών δεδομένων
Υποβολή αιτήσεων:
Αποστολή αναλυτικού βιογραφικού σημειώματος και δύο συστατικών επιστολών στο email: eleni.theodosiou@certh.gr μέχρι την Παρασκευή 15 Μαϊου 2025, με θέμα «Αίτηση για τη θέση Υ/Δ στη Συστημική Βιοτεχνολογία».
Για περισσότερες πληροφορίες μπορείτε να επικοινωνήσετε με τη Δρ. Ελένη Θεοδοσίου, Υπεύθυνη Συστημικής Βιοτεχνολογίας και Μεταβολομικής, ΙΝΕΒ/ΕΚΕΤΑ (eleni.theodosiou@certh.gr, Τηλ. 2311257536) καθώς και με τον Δρ. Πέτρο Καταπόδη, Αναπληρωτή Καθηγητή Βιοχημικής Μηχανικής, Τμήμα Βιολογικών Εφαρμογών και Τεχνολογιών (ΒΕΤ), Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων (pkatapo@uoi.gr).