Το σύνολο των Πιστωτικών Μονάδων (ΠΜ ή ECTS) που απαιτούνται για την απόκτηση του ΜΔΕ ανέρχεται σε 90 ECTS.

Α’ ΕΞΑΜΗΝΟ

• Δειγματοληψία, Ανάλυση Δεδομένων και Οικολογικά μοντέλα
• Εκτίμηση Βιοποικιλότητας και Βιοπαρακολούθηση Ειδών & Οικοτόπων
• Περιβαλλοντικός Σχεδιασμός και Διαχείριση Φυσικών Περιοχών
• Δυναμική Ιχθυοπληθυσμών και Διαχείριση Θαλάσσιων Βιολογικών Πόρων

Β’ ΕΞΑΜΗΝΟ

• Αξιολόγηση, Προστασία και Διαχείριση Υδάτινων Οικοσυστημάτων
• Επιπτώσεις των καταπονήσεων και της κλιματικής αλλαγής στα Μεσογειακά Φυτά
• Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία - Έναρξη της ερευνητικής δραστηριότητας (συλλογή & αξιολόγηση βιβλιογραφίας, πειραματικός & δειγματοληπτικός σχεδιασμός).

Γ’ ΕΞΑΜΗΝΟ

• Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία - Ολοκλήρωση ερευνητικής δραστηριότητας (υλοποίηση πειραμάτων & δειγματοληψιών, συγγραφή και παρουσίαση της διπλωματικής εργασίας).