A΄ Εξάμηνο

• Εκκλησιαστική Ιστορία
•  Ποιμαντική Θεολογία και Κανονικό Δίκαιο
•  Παιδαγωγική και Χριστιανική Παιδαγωγική
•  Πατερική - Συστηματική Θεολογία

Β΄ Εξάμηνο

• Βιβλική Θεολογία
•  Θέματα Ποιμαντικής Πρακτικής και Εκκλησιαστικής Διοίκησης
•  Ιστορία και Θεολογία της Λατρείας και της Βυζαντινής Τέχνης
• .Διαχριστιανικός και Διαθρησκειακός Διάλογος

Γ΄ Εξάμηνο

• Μεθοδολογία της Επιστημονικής Έρευνας και Συγγραφής
•  Μεταπτυχιακή Διπλωματική Διατριβή

Σεμινάρια:

Παράλληλα με τα εντατικά μαθήματα το Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα προσφέρει δωρεάν ενισχυτικά Σεμινάρια ως εξής:

• Τόποι Λατρείας και Δρόμοι του Μοναχισμού (τομέας θρησκευτικού τουρισμού).
• Μορφές Πρακτικής της Ορθοδόξου Λατρείας και Ποιμαντικής Πράξης στην καθημερινή ζωή της Εκκλησίας.
• Μεθοδολογία έρευνας με τη χρήση Η/Υ για τον σχεδιασμό και τη συγγραφή επιστημονικής εργασίας