Το πρόγραμμα των μαθημάτων διαμορφώνεται ως εξής:

Α' Εξάμηνο 

• Φυσική Ατμόσφαιρας (Ηλιακή και Γήινη ακτινοβολία Θερμοδυναμική της ατμόσφαιρας) (6 ECTS)
• Δυναμική των γεωφυσικών ρευστών (6 ECTS)
• Μέθοδοι ανάλυσης δεδομένων (6 ECTS)
• Αριθμητικές μέθοδοι – εφαρμογές στα γεωφυσικά ρευστά (2 ώρες + 2 εργαστήριο) (6 ECTS)
• Ατμοσφαιρική Φυσική και Χημεία (6 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Β' Εξάμηνο 

• Μέθοδοι και Όργανα Περιβαλλοντικών μετρήσεων (εργαστήριο) (5 ECTS)
• Δυναμική Ατμόσφαιρας (5 ECTS)

και τέσσερα από τα παρακάτω:

• Ατμοσφαιρικό Οριακό Στρώμα (5 ECTS)
• Συνοπτική Μετεωρολογία (5 ECTS)
• Φυσική δομημένου περιβάλλοντος (5 ECTS)
• Κλίμα – Κλιματικές διακυμάνσεις (5 ECTS)
• Φυσική Ωκεανογραφία (5 ECTS)
• Αρχές και εφαρμογές Τηλεπισκόπησης (5 ECTS)
• Φυσική μέσης και ανώτερης ατμόσφαιρας (5 ECTS)
• Μοντέλα ατμοσφαιρικής κυκλοφορίας (5 ECTS)
• Φυσική Νεφών και Φαινόμενα Μέσης Κλίμακας (5 ECTS)
• Ανανεώσιμες Πηγές Ενέργειας (5 ECTS)
• Ειδικό θέμα (προσφέρεται κάθε έτος ανάλογα με τη διαθεσιμότητα διδασκόντων) (5 ECTS) 

Σύνολο 30 ECTS

Γ' Εξάμηνο 

• Διπλωματική Εργασία (30 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Γενικό Σύνολο 90 ECTS