1. Μεταπτυχιακό MSc Ηλεκτρολόγων Μηχανικών με Διατριβή 

Α' Εξάμηνο 

• EEN 511 Ψηφιακές Επικοινωνίες (8 ECTS)
• EEN 512 Προχωρημένη Ψηφιακή Επεξεργασία Σημάτων Ι (8 ECTS)
• EEN 514 Προχωρημένα Θέματα Συστημάτων Ισχύος (8 ECTS)
• Τμηματική Επιλογή (7-8 ECTS) 

Σύνολο 31-32 ECTS 

Β' Εξάμηνο

• EEN 513 Θέματα Θεωρίας Συστημάτων και Αυτομάτου Ελέγχου (8 ECTS)
• Τμηματική Επιλογή (8 ECTS)
• EEN 515 Ερευνητικές Μεθόδοι (7 ECTS)
• Ελεύθερη Επιλογή (6-8 ECTS)

Σύνολο 29-31 ECTS  

Θερινή περίοδος 

• EEN 580 Διατριβή Μάστερ (30 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS   

2. Μεταπτυχιακό MSc Ηλεκτρολόγων Μηχανικών χωρίς Διατριβή

Α' Εξάμηνο 

• EEN 511 Ψηφιακές Επικοινωνίες (8 ECTS)
• EEN 512 Προχωρημένη Ψηφιακή Επεξεργασία Σημάτων Ι (8 ECTS)
• EEN 514 Προχωρημένα Θέματα Συστημάτων Ισχύος (8 ECTS)
• Τμηματική Επιλογή (7-8 ECTS) 

Σύνολο 31-32 ECTS  

Β' Εξάμηνο 

• EEN 13 Θέματα Θεωρίας Συστημάτων και Αυτομάτου Ελέγχου (8 ECTS)
• Τμηματική Επιλογή (7-8 ECTS)
• Τμηματική Επιλογή (7-8 ECTS)
• Τμηματική Επιλογή (7-8 ECTS)

Σύνολο 29-32 ECTS   

Γ' Εξάμηνο 

• Τμηματική Επιλογή (7-8 ECTS)
• Τμηματική Επιλογή (7-8 ECTS) 
• Ελεύθερη Επιλογή (6-8 ECTS)
• Ελεύθερη Επιλογή (6-8 ECTS)

Σύνολο 28-32 ECTS   

Τμηματικές Επιλογές:

• EEN 541 - Ηλεκτρονικά Ισχύος και Ανανεώσιμες Πηγές Ενέργειας (7 ECTS)
• EEN 542 - Προχωρημένη Θεωρία Συστημάτων και Αυτομάτου Ελέγχου (8 ECTS)
• EEN 543 - Ψηφιακή Επεξεργασία Εικόνας (7 ECTS)
• EEN 544 - Προχωρημένη Ψηφιακή Επεξεργασία Σημάτων II (8 ECTS)
• EEN 545 - Φωτονική (7 ECTS)
• EEN 546 - Τεχνολογίες Ασύρματων Δικτύων (7 ECTS)
• EEN 547 - Θέματα Ανώτερων Μαθηματικών για Μηχανικούς (7 ECTS)
• EEN 548 - Διαχείριση Έργων Μηχανικής (7 ECTS)
• EEN 549 - Προχωρημένη Σχεδίαση VLSI και Ενσωματωμένα Συστήματα (7 ECTS)
• EEN 550 - Προχωρημένη Ηλεκτρονική (7 ECTS)
• EEN 551 - Θεραπευτικοί Υπερήχοι με Καθοδήγηση Μαγνητικής Τομογραφίας (7 ECTS)
• EEN 552 - Ασύρματες Επικοινωνίες (7 ECTS)
• EEN 553 - Κυματοδηγοί και Θεωρία Κεραιών (8 ECTS)
• EEN 554 - Ιατρική Απεικόνιση (8 ECTS)
• EEN 555 - Ανανεώσιμες Πηγές Ενέργειας (7 ECTS)
• EEN 556 -  Έλεγχος και Λειτουργία Συστημάτων Ηλεκτρικής Ενέργειας (8 ECTS)
• EEN 558 - Ανεξάρτητη Μελέτη (3 ECTS)
• EEN 559 - Εξειδικευμένα Θέματα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών  (7 ECTS) 
• EEN 515 - Ερευνητικές Μέθοδοι  (7 ECTS) 

Άλλες Τμηματικές Επιλογές:

Εναλλακτικά οι φοιτητές μπορούν να εγγραφούν στα ακόλουθα επιλεγόμενα μαθήματα του μεταπτυχιακού προγράμματος MSc Μηχανικών Η/Υ και Πληροφορικής:

• CEI 525 - Προχωρημένα Θέματα Αρχιτεκτονικής και Παράλληλων Υπολογιστών
• CEI 561 - Ανάκτηση Πληροφορίας και Σημασιολογικός Ιστός
• CEI 562 - Προχωρημένα Θέματα Ψηφιοποίησης Πολιτιστικής Κληρονομιάς
• CEI 563 - Προχωρημένα Θέματα Παράλληλης  Επεξεργασίας και Κατανεμημένων Συστημάτων
• CEI 523 - Επιστήμη Δεδομένων
• CEI 565 - Διαχείριση Έργων Λογισμικού
• CEI 524 - Επιστήμη Δικτύων
• CEI 568 - Γραφικά Υπολογιστών: Μοντελοποίηση και Ανακατασκευή Αντικειμένων
• CEI 569 - Προχωρημένα Θέματα Ασφάλειας Υπολογιστών και Κρυπτογραφίας

Για τα ΜΗΥΠ 562, 563, 564, και 569, απαιτείται ο φοιτητής να μην έχει παρακολουθήσει μάθημα ομοίου η ιδίου αντικειμένου στο προπτυχιακό του πρόγραμμα.