Το πρόγραμμα σπουδών περιλαμβάνει δώδεκα (12) υποχρεωτικά μαθήματα τα οποία διδάσκονται τα δύο πρώτα εξάμηνα φοίτησης. Κάθε εξάμηνο μαθημάτων περιλαμβάνει 12 πλήρεις διδακτικές εβδομάδες και αντιστοιχεί σε 30 πιστωτικές μονάδες (ECTS). Στο ΠΜΣ δεν υπάρχουν μαθήματα ελεύθερης επιλογής.

Τα δύο πρώτα εξάμηνα οι φοιτητές παρακολουθούν συνολικά 12 μαθήματα, ενώ το τρίτο εξάμηνο εκπονούν τη μεταπτυχιακή διπλωματική τους εργασία. Κάθε μάθημα είναι διάρκειας 3 ωρών και αντιστοιχεί σε 5 πιστωτικές μονάδες του συστήματος European Credit Transfer Scheme (E.C.T.S). Η μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία αντιστοιχεί σε 30 πιστωτικές μονάδες του συστήματος E.C.T.S. To Δίπλωμα Μεταπτυχιακών Σπουδών απονέμεται μετά τη συμπλήρωση 90 πιστωτικών μονάδων (E.C.T.S.).

Τα μαθήματα περιλαμβάνουν θεωρητική και εργαστηριακή διδασκαλία ως μια ενιαία εκπαιδευτική ενότητα.

Επίσης προβλέπεται η συμμετοχή των μεταπτυχιακών φοιτητών σε σεμινάρια, workshops, ημερίδες, συνέδρια και επισκέψεις σε σχετικούς χώρους εργασίας.

Το πλήθος των προσφερόμενων μαθημάτων καθώς και το περιεχόμενο τους αποτελούν τακτικά αντικείμενο επικαιροποίησης από τη Συνέλευση του τμήματος, προκειμένου το προσφερόμενο πρόγραμμα σπουδών να ανταποκρίνεται κάθε φορά στις εξελίξεις που αφορούν τα γνωστικά αντικείμενα της Φυσικοθεραπείας και της Φυσιολογίας αλλά και της αγοράς εργασίας.

Ως κύρια γλώσσα διδασκαλίας των μαθημάτων σε κάθε τους μορφή (θεωρία, ασκήσεις, εργαστήρια, εξετάσεις, κλπ), ορίζεται η ελληνική.

Τα μαθήματα κάθε κύκλου ξεκινούν το Χειμερινό εξάμηνο του ακαδημαϊκού έτους μετά την λήξη της εξεταστικής περιόδου. Κάθε διδακτικό εξάμηνο περιλαμβάνει 12 εβδομάδες για διδασκαλία και δύο εβδομάδες για τις εξετάσεις.

Εφόσον με υπαιτιότητα του διδάσκοντα ή για λόγους ανωτέρας βίας δεν πραγματοποιηθεί ένα μάθημα στην προβλεπόμενη ημέρα και ώρα, το μάθημα αναπληρώνεται σε χρόνο που θα συμφωνηθεί από τον διδάσκοντα με το σύνολο των εγγεγραμμένων φοιτητών.

Τα μαθήματα του προγράμματος με τις αντίστοιχες πιστωτικές μονάδες περιγράφονται παρακάτω:

Α' Εξάμηνο 

• Φυσιολογία της άσκησης (5 ECTS)
• Διατροφή και μεταβολισμός (5 ECTS)
• Θεωρία της Επιστήμης (5 ECTS)
• Στατιστική της Φυσιολογίας (5 ECTS)
• Εφαρμοσμένη Ιατρική Πληροφορική (5 ECTS)
• Ερευνητικές Μέθοδοι στην Εξάσκηση Φυσιολογίας (5 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Β' Εξάμηνο 

• Προχωρημένη Εργοφυσιολογία (5 ECTS)
• Προχωρημένη Αθλητική Φυσικοθεραπεία (5 ECTS)
• Μυοσκελετική Αποκατάσταση (5 ECTS)
• Προχωρημένη Αθλητιατρική (5 ECTS)
• Προχωρημένη Κινησιολογία (5 ECTS)
• Μεθοδολογία Έρευνας και Νέες Τεχνολογίες (5 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Γ' Εξάμηνο 

• Διπλωματικής Εργασία (30 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS