Το σύνολο των Πιστωτικών Μονάδων (ECTS) που απαιτούνται για την απόκτηση του Μ.Δ.Ε. είναι ενενήντα (90).

Το Π.Μ.Σ. θα είναι πλήρους φοίτησης και οι μεταπτυχιακοί φοιτητές θα πρέπει να παρακολουθήσουν συνολικά οκτώ (8) εξαμηνιαία μαθήματα. Κάθε μεταπτυχιακός φοιτητής θα υποχρεούται να παρακολουθήσει και να εξετασθεί επιτυχώς σε μαθήματα που αντιστοιχούν σε τριάντα (30) πιστωτικές μονάδες ανά εξάμηνο σπουδών (Α΄ και Β΄ εξάμηνο) και να εκπονήσει επιτυχώς τη μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία, η οποία αντιστοιχεί σε τριάντα (30) πιστωτικές μονάδες, κατά το Γ΄ εξάμηνο.

Το πρόγραμμα μαθημάτων ανά εξάμηνο διαμορφώνεται ως εξής: 

Α' Εξάμηνο 

• Γεωργικές Μονάδες Ελεγχόμενου Περιβάλλοντος (Controlled Environment Agricultural Systems) (8 ECTS)
  • Κατασκευαστικά Στοιχεία (Structural Components)
  • Μικρομετεωρολογία (Micrometeorology)
  • Διαχείριση Ενέργειας και Πόρων (Energy and Resource Management)
• Υδροπονικά Συστήματα (Hydroponic Systems) (8 ECTS)
• Παραγωγή Πολλαπλασιαστικού Υλικού σε Ελεγχόμενο Περιβάλλον (Plant Propagation under Controlled Environment) (7 ECTS)
• Οικονομοτεχνική Ανάλυση σε Μονάδες Ελεγχόμενου Περιβάλλοντος (Economic and Technical Analysis in Controlled Environment Units) (7 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Β' Εξάμηνο 

• Τεχνικές και Ειδικά Θέματα θρέψης Ανθοκηπευτικών και Φαρμακευτικών Φυτών σε Υδροπονικές Καλλιέργειες (Techniques and Specific Issues in Plant Nutrition in Hydroponic Cultivation of Vegetables, Floriculture and Medicinal plants) (9 ECTS)
• Μετασυλλεκτική Τεχνολογία (Postharvest Technology) (7 ECTS)
• Βιοτεχνολογία Φυτών σε Ελεγχόμενο Περιβάλλον (Plant Biotechnology under Controlled Environment) (7 ECTS)
• Ολοκληρωμένη Διαχείριση Εχθρών και Ασθενειών σε Ελεγχόμενο Περιβάλλον (Integrated Pest Management in Controlled Environment) (7 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Γ' Εξάμηνο 

• Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία (Master thesis) (30 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS