Το Π.Μ.Σ. είναι πλήρους φοίτησης. Για την απόκτηση του ΜΔΕ, οι μεταπτυχιακοί φοιτητές υποχρεούνται σε παρακολούθηση και επιτυχή εξέταση μεταπτυχιακών μαθημάτων καθώς και εκπόνηση και επιτυχή εξέταση της μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας. Ο συνολικός αριθμός των μαθημάτων του προγράμματος που πρέπει να παρακολουθήσουν και να εξεταστούν επιτυχώς οι μεταπτυχιακοί φοιτητές ανέρχεται σε δέκα (10), από τα οποία 6 είναι υποχρεωτικά και 4 κατ’ επιλογής. Κάθε μάθημα του 1ου εξαμήνου αντιστοιχεί σε έξι (6) πιστωτικές μονάδες, ενώ στο δεύτερο εξάμηνο σε πέντε (5) πιστωτικές μονάδες, εκτός του μαθήματος «Σχεδίαση μηχατρονικού έργου» που αντιστοιχεί σε δέκα (10) πιστωτικές μονάδες. Κάθε φοιτητής υποχρεούται να παρακολουθήσει και να εξεταστεί επιτυχώς σε μαθήματα που αντιστοιχούν σε τριάντα (30) πιστωτικές μονάδες ανά εξάμηνο σπουδών. Η μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία αντιστοιχεί σε τριάντα (30) πιστωτικές μονάδες. Η γλώσσα διδασκαλίας είναι η ελληνική ή/και η αγγλική γλώσσα. Το Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης απονέμεται μετά την επιτυχή συμπλήρωση ενενήντα (90) πιστωτικών μονάδων. Αναλυτικά το πρόγραμμα μαθημάτων του Π.Μ.Σ. έχει ως εξής:

Α' Εξάμηνο 

• Αισθητήρες και Επεξεργασία σημάτων (6 ECTS) 
• Μηχανική Συμπεριφορά (6 ECTS) 
• Μικροεπεξεργαστές και ενσωματωμένα συστήματα (6 ECTS) 
• Έλεγχος Βιομηχανικών Συστημάτων (6 ECTS) 
• Ηλεκτρονικά Ισχύος και μέθοδοι οδήγησης κινητήρων (6 ECTS) 

Σύνολο 30 ECTS 

Β' Εξάμηνο 

• Σχεδίαση μηχατρονικού έργου (10 ECTS) 

και τέσσερα από τα παρακάτω:

• Προχωρημένα θέματα Εποπτικού Ελέγχου και Συλλογής Δεδομένων (5 ECTS) 
• Βιομηχανικά ρομπότ (5 ECTS) 
• Υλικά και Σχεδίαση (5 ECTS) 
• Υδραυλικά και πνευματικά συστήματα ισχύος (5 ECTS) 
• Σχεδίαση μηχανολογικών συστημάτων (5 ECTS) 
• Βιομηχανικές Επικοινωνίες (5 ECTS) 

Σύνολο 30 ECTS 

Γ' Εξάμηνο 

• Μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία (30 ECTS) 

Σύνολο 30 ECTS