Η επιτυχής ολοκλήρωση του προγράμματος περιλαμβάνει την παρακολούθηση και εξέταση σε 26 υποχρεωτικά μαθημάτων και την εκπόνηση της διπλωματικής εργασίας. Η δομή του προγράμματος είναι η ακόλουθη: 

Α΄ Εξάμηνο 

• Μορφολογική Ανατομία Ελάσσονος Πυέλου και Περινέου (3 ECTS)
• Απεικονιστική Ανατομία Πυέλου (3 ECTS)
• Λαπαροσκοπικές και ενδοσκοπικές τεχνικές στην Ελάσσονα Πύελο του θήλεος (3 ECTS)
• Ενδοσκοπικές τεχνικές Ορθοπρωκτικού Σωλήνα. Διαγνωστικές και θεραπευτικές δυνατότητες (3 ECTS)
• Ουρηθροκυστεοσκόπηση διαγνωστικές και θεραπευτικές εφαρμογές (3 ECTS)
• Ακράτεια Ούρων (3 ECTS)
• Φυσιολογία του Ορθοπρωκτικού Σωλήνα και του πυελικού εδάφους (3 ECTS)
• Δυσκοιλιότητα και απόφραξη πυελικής εξόδου (3 ECTS)
• Ακράτεια κοπράνων (3 ECTS)
• Πρόπτωση πυελικών οργάνων και αντιμετώπισή τους (3 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Β΄ Εξάμηνο 

• Ορθοπρωκτικές φλεγμονές και λοιμώξεις (3 ECTS)
• Αιμορροϊδοπάθεια και αντιμετώπισή της (3 ECTS)
• Κακώσεις πυέλου και περινέου (3 ECTS)
• Νεοπλασίες Ορθοπρωκτικού Σωλήνα- Θεραπευτικές στρατηγικές και τεχνικές (3 ECTS)
• Τοπικά προχωρημένες νεοπλασίες κατωτέρου ουροποιητικού (2 ECTS)
• Τοπικά προχωρημένες νεοπλασίες γεννητικών οργάνων θήλεος - Θεραπευτικές στρατηγικές και τεχνικές (2 ECTS)
• Ενδείξεις, τεχνικές και αποτελέσματα εξεντερώσεων (2 ECTS)
• Αναισθησία και περιεχειρητική αντιμετώπιση σε επεμβάσεις Ελάσσονος Πυέλου (2 ECTS)
• Διπλωματική Εργασία (10 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS 

Η γλώσσα διδασκαλίας του Π.Μ.Σ είναι η Ελληνική ή Αγγλική.

Η γλώσσα εκπόνησης διπλωματικής εργασίας είναι η Ελληνική ή Αγγλική.