Το σύνολο των πιστωτικών μονάδων (ECTS) που απαιτούνται για την απονομή του Μεταπτυχιακού Διπλώματος Ειδίκευσης ανέρχονται σε ενενήντα (90).

Για την απονομή του Μ.Δ.Ε. απαιτείται:

1) Η υποχρεωτική παρακολούθηση και επιτυχή εξέταση σε μαθήματα στα δύο πρώτα εξάμηνα, με συνολικό φόρτο 60 πιστωτικών μονάδων (ECTS), 30 πιστωτικές μονάδες (ECTS) κάθε εξάμηνο, με τις εξής προϋποθέσεις:

α) έξι (6) μαθήματα κορμού της κατεύθυνσης που έχει επιλέξει ο φοιτητής, τρία (3) σε κάθε εξάμηνο

β) επιπλέον δυο (2) μαθήματα επιλογής ή κορμού της κατεύθυνσης που έχει επιλέξει ο φοιτητής, ένα (1) σε κάθε εξάμηνο

γ) επιπλέον δυο (2) μαθήματα κορμού ή επιλογής συνολικά από τις άλλες δυο (2) προσφερόμενες κατευθύνσεις, ένα (1) σε κάθε εξάμηνο

2) Η εκπόνηση της Μεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας, το τρίτο εξάμηνο, και η επιτυχής εξέταση του φοιτητή σε αυτή που πιστώνεται με τριάντα (30) πιστωτικές μονάδες (ECTS).

'Α ΕΞΑΜΗΝΟ

Κατεύθυνση Εφαρμογών και Θεμελιώσεων της Επιστήμης των Υπολογιστών

• Προχωρημένοι Αλγόριθμοι Επικοινωνιών- Κορμού
• Μηχανισμοί Ποιότητας Υπηρεσίας σε Δίκτυα- Κορμού
• Θεωρία Προσεγγιστικών Αλγορίθμων- Κορμού
• Πιθανοτικοί Αλγόριθμοι- Κορμού
• Ειδικά Θέματα Θεμελιώσεων της Επιστήμης των Υπολογιστών-Επιλογής
• Αλγόριθμοι και Βελτιστοποίηση-Επιλογής
• Λογική και Λογικός Προγραμματισμός-Επιλογής
• Οικονομικά της Τεχνολογίας-Επιλογής

Κατεύθυνση Λογισμικού των Υπολογιστών 

• Διαχείριση Σύνθετων Αντικειμένων Πολλαπλών-Μέσων σε Βάσεις Δεδομένων- Κορμού
• Ανάλυση της Απόδοσης Πληροφοριακών Συστημάτων- Κορμού
• Ειδικά Θέματα Βάσεων Χωρικών και Χρονικών Δεδομένων και Εξόρυξης Γνώσης- Κορμού
• Ειδικά Θέματα Επιστημονικού Υπολογισμού- Κορμού
• Ειδικά Θέματα Ανάκτησης Πληροφορίας- Επιλογής 
• Ειδικά Θέματα Τεχνητής Νοημοσύνης-Επιλογής 
• Ειδικά Θέματα Δεδομένων Μεγάλου Όγκου-Επιλογής 
• Ειδικά Θέματα Παράλληλης Επεξεργασίας και Υπολογισμών Υψηλής Επίδοση –Επιλογής.

Κατεύθυνση Υλικού και Αρχιτεκτονικής των Υπολογιστών        

• Υπολογιστικά Συστήματα Υψηλής Αξιοπιστίας- Κορμού
• Κινητά Δίκτυα Επικοινωνιών- Κορμού
• Προχωρημένα Θέματα Οπτικών Δικτύων- Κορμού
• Υπολογιστική Όραση και Γραφική- Κορμού
• Αρχές Ασύρματης Επικοινωνίας- Επιλογής 
• Σχεδίαση Συστημάτων Χαμηλής Κατανάλωσης Ισχύος- Επιλογής 
• Θεωρία Βελτιστοποίησης-Επιλογής

Β’ ΕΞΑΜΗΝΟ

Κατεύθυνση Εφαρμογών και Θεμελιώσεων της Επιστήμης των Υπολογιστών          

• Θεωρία Υπολογισμού και Μαθηματική λογική- Κορμού
• Αλγόριθμοι Μάθησης- Κορμού
• Προχωρημένα Θέματα Αδόμητων Δικτύων- Κορμού
• Προηγμένα Θέματα Τεχνολογιών Υλοποίησης Αλγορίθμων- Κορμού
• Προχωρημένα Θέματα Αλγορίθμων Άμεσης Απόκρισης- Επιλογής
• Τεχνικές και Αλγόριθμοι Συμπίεσης Εικόνας- Επιλογής 
• Ειδικά Θέματα Αλγορίθμων- Επιλογής 
• Προχωρημένα Θέματα Βιοπληροφορικής- Επιλογής 

Κατεύθυνση Λογισμικού των Υπολογιστών 

• Θεωρία Βασικών Δομών Δεδομένων- Κορμού
• Προχωρημένα Θέματα σε Κατανεμημένα Συστήματα- Κορμού
• Ευφυή Συστήματα Αποφάσεων- Κορμού
• Μέθοδοι και Τεχνολογίες για Διαχείριση Μεγάλου Όγκου Δεδομένων- Κορμού
• Ειδικά Θέματα Τεχνολογίας Λογισμικού- Επιλογής 
• Ειδικά Θέματα Ασφάλειας- Επιλογής 
• Ειδικά Θέματα Υπολογισμών Έντασης Δεδομένων- Επιλογής 

Κατεύθυνση Υλικού και Αρχιτεκτονικής των Υπολογιστών        

• Ειδικά Θέματα Ελέγχου Ορθής Λειτουργίας VLSI Συστημάτων - Σχεδιασμός για Εύκολο Έλεγχο- Κορμού
• Τηλεπικοινωνιακά Δίκτυα Υψηλών Ταχυτήτων- Κορμού 
• Στοχαστικά Σήματα και Επικοινωνίες- Κορμού
• Ψηφιακή Επεξεργασία και Ανάλυση Εικόνας- Κορμού
• Θεωρία Εκτίμησης και Στοχαστικού Ελέγχου- Επιλογής
• Νανοηλεκτρονική και Κβαντικές Πύλες- Επιλογής
• Σύνθεση και Βελτιστοποίηση Ψηφιακών Κυκλωμάτων και Συστημάτων- Επιλογής 

Γ' Εξάμηνο

• Συγγραφή και εκπόνηση της Μεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας