Η ολοκλήρωση του προγράμματος απαιτεί 90 ECTS και φοίτηση διάρκειας τριών τουλάχιστον εξαμήνων. Τα 90 ECTS αντιστοιχούν σε οκτώ μαθήματα και διατριβή. Συγκεκριμένα:

• Επτά μεταπτυχιακά μαθήματα (8 ECTS το καθένα)
• Ένα μεταπτυχιακό μάθημα (4 ECTS) (ΕΠΛ 671 Ερευνητικές Μέθοδοι στην Πληροφορική)
• Μεταπτυχιακή διατριβή μάστερ (30 ECTS)

Τα επτά μεταπτυχιακά μαθήματα προέρχονται από τον κατάλογο των προσφερόμενων μεταπτυχιακών μαθημάτων του Τμήματος και επιλέγονται από τον κάθε φοιτητή υπό την επίβλεψη του ακαδημαϊκού του συμβούλου. 

Προσφερόμενα μαθήματα 

• ΕΠΛ601 – Κατανεμημένα Συστήματα
• ΕΠΛ602 – Θεμελιώσεις Τεχνολογιών Διαδικτύου
• ΕΠΛ603 – Προχωρημένα Θέματα Τεχνολογίας Λογισμικού
• ΕΠΛ604 – Τεχνητή Νοημοσύνη
• ΕΠΛ605 – Προχωρημένη Αρχιτεκτονική Υπολογιστών
• ΕΠΛ606 – Δίκτυα Υπολογιστών και το Διαδίκτυο
• ΕΠΛ607 – Γραφικός και Εικονικός Υπολογισμός
• ΕΠΛ646 – Προχωρημένα Θέματα Βάσεων Δεδομένων
• ΕΠΛ651 – Κινητός Υπολογισμός και Διαχείριση Δεδομένων
• ΕΠΛ653 – Ανάπτυξη Λογισμικού Ηλεκτρονικών Παιχνιδιών
• ΕΠΛ655 – Προχωρημένη Παράλληλη Επεξεργασία
• ΕΠΛ656 – Γραφικά: Μοντελοποίηση και Ρεαλισμός
• ΕΠΛ657 – Ασύρματα Δίκτυα Υπολογιστών
• ΕΠΛ658 – Ψηφιακή Επεξεργασία Βίντεο
• ΕΠΛ659 – Σχεδιασμός με Ενσωματωμένους Επεξεργαστές
• ΕΠΛ660 – Ανάκτηση Πληροφοριών και Μηχανές Αναζήτησης
• ΕΠΛ662 – Μηχανική Μάθηση και Εξόρυξη Δεδομένων
• ΕΠΛ663 – Υπολογιστική Λογική
• ΕΠΛ664 – Ανάλυση και Επαλήθευση Συστημάτων
• ΕΠΛ665 – Μέθοδοι Επίλυσης Προβλημάτων Περιορισμών
• ΕΠΛ667 – Νευροπληροφορική
• ΕΠΛ668 – Μηχανική Όραση
• ΕΠΛ673 – Αλγοριθμική Θεωρία Παιγνίων
• ΕΠΛ674 – Ασφάλεια Συστημάτων και Δικτύων
• ΕΠΛ675 – Υπηρεσίες Διαδικτύου και Υπολογισμός - Προσανατολισμένος προς τις Υπηρεσίες
• ΕΠΛ678 – Χρονικά Πληροφοριακά Συστήματα στην Ιατρική
• ΕΠΛ679 – Ηλεκτρονική Υγεία
• ΕΠΛ699 – Ειδικά Θέματα στην Πληροφορική