Για την απόκτηση του Δ.Μ.Σ. απαιτείται η επιτυχής εξέταση σε όλα τα μαθήματα του προγράμματος καθώς και η επιτυχής εξέταση της μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας. Σε εφαρμογή του υπό στοιχεία Φ5/89656/Β3 (Β΄ 1466/2007), τα μαθήματα αντιστοιχούν σε τριάντα (30) πιστωτικές μονάδες ανά εξάμηνο σπουδών. Η διπλωματική εργασία αντιστοιχεί επίσης σε τριάντα (30) πιστωτικές μονάδες. Συνολικά απαιτείται η συμπλήρωση ενενήντα (90) πιστωτικών μονάδων.

Αναλυτικά το πρόγραμμα μαθημάτων του Π.Μ.Σ. έχει ως εξής:

Πρόγραμμα μαθημάτων ανά ακαδημαϊκό εξάμηνο

1ο Εξάμηνο: 1st SEMESTER

• Advanced Transport phenomena Προηγμένα φαινόμενα μεταφοράς (6 ECTS)
• Computer-aided (Chemical/Bio)-Process Design and Simulation Σχεδιασμός και Προσομοίωση Χημικών/Βιοχημικών Διεργασιών με τη βοήθεια Υπολογιστικών Μεθόδων (6 ECTS)
• (Chemical/Bio)-Process Instrumentation and Control Οργανολογία και Έλεγχος Χημικών/Βιοχημικών Διεργασιών (6 ECTS)
• Advanced Biochemical & Physicochemical Processes Προηγμένες Βιοχημικές και Φυσικοχημικές Διεργασίες (6 ECTS)
• Advanced Materials Processing Προηγμένες Διεργασίες Επεξεργασίας Υλικών (6 ECTS)

2ο Εξάμηνο: 2 nd SEMESTER

• Hydrogen Technology Τεχνολογία Υδρογόνου (6 ECTS)

Επιλογή (1):

• Research Methods and Project Management Ερευνητικές Μέθοδοι και Διαχείριση Έργου (6 ECTS)
• Circular Bio/Economy, Sustainability Κυκλική Βιο/Οικονομία, Αειφορία (6 ECTS)

Επιλογή (3):

• Catalysis for Energy and Environmental Applications Κατάλυση Ενεργειακών & Περιβαλλοντικών εφαρμογών (6 ECTS)
• Clean Energy, Functional Materials Καθαρή ενέργεια, Λειτουργικά Υλικά (6 ECTS)
• Biorefinery Processes Διεργασίες Βιοδιυλιστηρίων (6 ECTS)
• Industrial Materials Βιομηχανικά Υλικά (6 ECTS)
• Advanced Process Engineering for Water Purification Προηγμένες Διεργασίες Μηχανικής Καθαρισμού/Απολύμανσης Υδάτων (6 ECTS)
• Computational Methods for Environmental assessment Υπολογιστικές Mέθοδοι Περιβαλλοντικής Αποτίμησης (6 ECTS)
• Food Process Engineering Μηχανική Διεργασιών Τροφίμων (6 ECTS)

3ο Εξάμηνο: 3rd SEMESTER

• Διπλωματική εργασία (Master thesis, Research project) (30 ECTS)