Κατά τη διάρκεια των σπουδών οι μεταπτυχιακοί φοιτητές/-τριες υποχρεούνται σε παρακολούθηση και επιτυχή αξιολόγηση έντεκα (11) μεταπτυχιακών μαθημάτων, καθώς και σε εκπόνηση και επιτυχή αξιολόγηση Μεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας (Μ.Δ.Ε.). Η Μ.Δ.Ε. εκπονείται κατά το τελευταίο εξάμηνο και αντιστοιχεί σε δέκα οκτώ (18) ECTS. 

Α’ Εξάμηνο
Υποχρεωτικά (Υ)

• Ανάλυση στρατιωτικών επιχειρήσεων Ι [7.5 ECTS]
• Νεότερη και Σύγχρονη Ελληνική Ιστορία 19ος - 20ος αι.[7.5 ECTS]
• Ιστορία του Πολέμου Ι (με έμφαση στη Στρατιωτική Στρατηγική), π. 1800-1918 [7.5 ECTS]
• Ιστορία Διεθνών Σχέσεων, 19ος-20ος αι. [7.5 ECTS]
• Υποχρεωτικό σεμινάριο (χωρίς αξιολόγηση): Μεθοδολογία συγγραφής επιστημονικής ιστορικής μελέτης

Β’ Εξάμηνο
Υποχρεωτικά (Υ)

• Ιστορία του Πολέμου ΙΙ: από τον Μεσοπόλεμο στον 21ο αι. [6 ECTS]
• Ελληνική Στρατιωτική Ιστορία Ι - Ανάλυση στρατιωτικών επιχειρήσεων (1821-1914) [6 ECTS]
• Εθνική Πολιτική Ασφάλειας και Εθνικά Θέματα, 1945 έως σήμερα [6 ECTS]

Επιλογής (Ε): δύο εκ των τεσσάρων [6 ECTS + 6 ECTS]

• Ελληνική Εξωτερική Πολιτική, 1821-1944
• Ιστορία της Στρατηγικής Σκέψης
• Η Ηθική του Πολέμου και η εξέλιξη του Διεθνούς Δικαίου (με έμφαση στο Δίκαιο Ένοπλων Συγκρούσεων και στο Δίκαιο της Θάλασσας)
• Ανάλυση στρατιωτικών επιχειρήσεων ΙΙ

Γ’ Εξάμηνο
Υποχρεωτικά (Υ)

• Ελληνική Στρατιωτική Ιστορία ΙΙ - Ανάλυση στρατιωτικών επιχειρήσεων (1917-1953) [6 ECTS]

Επιλογής (Ε): ένα εκ των τεσσάρων [6 ECTS]

• Οικονομία, Παραγωγή και Ένοπλες Δυνάμεις (19ος- 20ός αι.)
• Ναυτική Ιστορία και Στρατηγική (19ος-20ος αιώνας)
• Ο Αεροπορικός Πόλεμος
• Αποικιοκρατία, Επαναστάσεις, Πόλεμος και Ανορθόδοξος Πόλεμος στην ευρύτερη Μέση Ανατολή (π. 1900-2021)

Διπλωματική εργασία [18 ECTS]: αποτυπώνει και εδράζεται στο σύνολο των γνώσεων που έχουν αποκτηθεί κατά την διάρκεια φοίτησης στο Δ.Π.Μ.Σ. μέσω ενός συγκεκριμένου θέματος. Δημόσια παρουσίαση των διπλωματικών εργασιών και εξέταση.