Το ΠΜΣ ξεκινά το χειμερινό εξάμηνο εκάστου ακαδημαϊκού έτους.

Για την απόκτηση ΔΜΣ απαιτούνται συνολικά εκατόν είκοσι (120) πιστωτικές μονάδες (ECTS).

Το πρόγραμμα των μαθημάτων διαμορφώνεται ως εξής:

Α' Εξάμηνο 

• Μοριακή Βιολογία και Γονιδιωματική (6 ECTS)
• Βιομοριακή Δομή και Λειτουργία (6 ECTS)
• Γλώσσες Προγραμματισμού και Εργαλεία Λογισμικού στη Βιοπληροφορική Ι (6 ECTS)
• Στατιστική στη Βιοπληροφορική (6 ECTS)
• Αρχές και Μέθοδοι Βιοπληροφορικής (6 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Β' Εξάμηνο

• Υπολογιστική Ανάλυση Ακολουθιών Βιομακρομορίων (6 ECTS)
• Υπολογιστική Ανάλυση Δομών Βιομακρομορίων (6 ECTS)
• Γλώσσες Προγραμματισμού και Εργαλεία Λογισμικού στη Βιοπληροφορική ΙΙ (6 ECTS)
• Μοριακή Αναγνώριση – Ασθένειες – Δομικός Σχεδιασμός Φαρμάκων (6 ECTS)
• Μεθοδολογία της Έρευνας (6 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Γ' Εξάμηνο 

• Η πληροφορική στη μελέτη και προστασία της βιοποικιλότητα (6 ECTS)
• Διπλωματική εργασία [Έναρξη] (12 ECTS)

Μαθήματα Επιλογής:

• Ειδικά Θέματα Βιοπληροφορικής Ι: Δομές Δεδομένων – Βάσεις Δεδομένων – Σχεδιασμός Βάσεων Βιολογικών Δεδομένων (6 ECTS)
• Ειδικά Θέματα Βιοπληροφορικής ΙΙ: Αρχιτεκτονική Εφαρμογών Διαδικτύου και Βιοπληροφορική (6 ECTS)
• Ειδικά Θέματα Βιοπληροφορικής ΙΙΙ: Πολύπλοκα Βιολογικά Συστήματα (6 ECTS)
• Ειδικά Θέματα Βιοπληροφορικής IV: Τεχνολογίες Μικροσυστοιχιών και Εφαρμογές (6 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Δ' Εξάμηνο 

• Εκπόνηση μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας [Ολοκλήρωση] (30 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Γενικό Σύνολο 120 ECTS