Το πρόγραμμα των μαθημάτων διαμορφώνεται ως εξής:

Α' Εξάμηνο 

• Λειτουργική ανατομία πνεύμονα – Μηχανικοί αμυντικοί μηχανισμοί (6 ECTS)
• Κλινικός παρακλινικός έλεγχος αναπνευστικού συστήματος (6 ECTS)
• Εξειδικευμένος έλεγχος του αναπνευστικού συστήματος (5 ECTS)
• Ανοσολογία – Αλλεργία (5 ECTS)
• Αρχές θεραπευτικής (4 ECTS)
• Μεθοδολογία έρευνας και συγγραφής επιστημονικού άρθρου (4 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Β' Εξάμηνο 

• Άσθμα – υποτροπιάζων συριγμός (5 ECTS)
• Λοιμώξεις αναπνευστικού – Βρογχεκτασία – Αντιβιοτικά (5 ECTS)
• Κυστική Ίνωση – Φυματίωση (5 ECTS)
• Πρωτοπαθής δυσκινησία κροσσών – Συγγενείς πνευμονοπάθειες (5 ECTS)
• Εκπόνηση 1ης εργασίας: «Άρθρο Ανασκόπησης» (10 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Γ' Εξάμηνο 

• Συμμετοχή πνεύμονα σε συστηματικά νοσήματα – Νεοπλασίες (6 ECTS)
• Οξεία και χρόνια αναπνευστική ανεπάρκεια (7 ECTS)
• Οξέα συμβάματα – νοσήματα υπεζωκότα (5 ECTS)
• Διάμεσα και διάχυτα πνευμονικά νοσήματα (5 ECTS)
• Περιβάλλον – Άθληση (4 ECTS)
• Επιδημιολογία και βιοστατιστική (3 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

Δ' Εξάμηνο 

• Πρακτική κλινική άσκηση στο γνωστικό αντικείμενο της Παιδιατρικής Πνευμονολογίας (5 ECTS)
• Εκπόνηση μεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας (25 ECTS)

Σύνολο 30 ECTS

ΓΕΝΙΚΟ ΣΥΝΟΛΟ: 120 ECTS