Για την απόκτηση διπλώματος του Π.Μ.Σ. απαιτούνται συνολικά ενενήντα (90) πιστωτικές μονάδες (ECTS). Όλα τα μαθήματα διδάσκονται εβδομαδιαίως και, κατά περίπτωση, περιλαμβάνουν εργαστηριακές ασκήσεις, σεμινάρια, πρακτική άσκηση, συγγραφή επιστημονικών εργασιών κα.

Η γλώσσα διδασκαλίας και συγγραφής της μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας είναι η ελληνική ή η αγγλική.

Η εκπόνηση της διπλωματικής εργασίας πραγματοποιείται στο Γ εξάμηνο σπουδών και πιστώνεται με τριάντα (30) ECTS.

Η διδασκαλία των μαθημάτων θα γίνεται διά ζώσης.

Το ενδεικτικό πρόγραμμα των μαθημάτων διαμορφώνεται ως εξής:

Α' ΕΞΑΜΗΝΟ

• Αρχές Ανοσολογικών Μηχανισμών - Κλινικές και Εργαστηριακές Εφαρμογές (12 ECTS)
• Συστηματικά Αυτοάνοσα Νοσήματα: Παθογένεση, Κλινική έκφραση, Διάγνωση, Θεραπεία (12 ECTS)
• Πρακτική άσκηση Ι (Εργαστηριακή) (6 ECTS)

ΣΥΝΟΛΟ 30 ECTS

B' ΕΞΑΜΗΝΟ

• Οργανοειδικά αυτοάνοσα νοσήματα: Παθογένεση, Κλινική έκφραση, Διάγνωση, Θεραπεία (12 ECTS)
• Αρχές Βασικής και Κλινικής Έρευνας (12 ECTS)
• Πρακτική άσκηση II (Κλινική) (6 ECTS)

ΣΥΝΟΛΟ 30 ECTS

Γ' ΕΞΑΜΗΝΟ

• Εκπόνηση Διπλωματικής Εργασίας

Στο Γ' εξάμηνο οι φοιτητές ασχολούνται με την συγγραφή της διπλωματικής τους εργασίας με θέμα που έχουν επιλέξει μαζί με τον επιβλέποντα Καθηγητή τους. 
Καταθέτουν την Αίτηση Εκπόνησης Διπλωματικής στην γραμματεία του Μεταπτυχιακού «Αρχές Ανοσολογικών Μηχανισμών - Κλινικές & Εργαστηριακές Εφαρμογές»

 Η ολοκλήρωση της διπλωματικής εργασίας διαρκεί 6 μήνες και με την ολοκλήρωση της οι φοιτητές καλούνται να την παρουσιάσουν ενώπιον της τριμελούς τους επιτροπής.
Για διευκόλυνση των φοιτητών υπάρχουν αναλυτικές οδηγίες για τον τρόπο συγγραφής της Διπλωματικής Εργασίας στον  «Οδηγό Εκπόνησης Μεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας».

ΣΥΝΟΛΟ 30 ECTS

ΓΕΝΙΚΟ ΣΥΝΟΛΟ 90 ECTS