Για την απόκτηση του Μ.Δ.Ε. ο φοιτητής πρέπει να παρακολουθήσει και να εξετασθεί με επιτυχία σε έξι (6) εξαμηνιαία μεταπτυχιακά μαθήματα (σύνολο 60 ECTS). O φοιτητής πρέπει να παρακολουθήσει το σύνολο των 6 μαθημάτων στη διάρκεια του πρώτου και δεύτερου εξαμήνου σπουδών ανά 3 μαθήματα το εξάμηνο και 30 ECTS το εξάμηνο. Η διπλωματική εργασία πιστώνεται με 40 ECTS. Η πορεία της μεταπτυχιακής του εργασίας παρακολουθείται τόσο κατά το τρίτο εξάμηνο με τη βοήθεια του σχετικού με την εκπόνηση της εργασίας μαθήματος Δ1 (20 ECΤS η μεταπτυχιακή εργασία και 10 ECΤS το μάθημα Δ1 = 30 ECΤS το εξάμηνο) όσο και κατά το τέταρτο εξάμηνο με τη βοήθεια του δεύτερου σχετικού με την εκπόνηση της εργασίας μαθήματος Δ2 (20 ECΤS η μεταπτυχιακή εργασία και 10 ECTS το μάθημα Δ2 = 30 ECΤS το εξάμηνο). Το σύνολο των ECTS στα τέσσερα εξάμηνα σπουδών είναι 80. 

Από το σύνολο των 80 ΕCTS, οι 60 ECTS πρέπει να προέρχονται από τον κατάλογο των μαθημάτων της Ειδίκευσης, στην οποία έχει εγγραφεί ο φοιτητής. Οι υπόλοιπες 20 ECTS μπορούν να προέρχονται από άλλες Ειδικεύσεις του Π.Μ.Σ. του Τμήματος ή κατά περίπτωση από άλλα Τμήματα στα οποία προσφέρονται συναφή μαθήματα. Οι μεταπτυχιακοί φοιτητές, οι οποίοι μετέχουν σε Ευρωπαϊκά Εκπαιδευτικά Προγράμματα, πρέπει να παρακολουθήσουν επιτυχώς 3 μαθήματα της συγκεκριμένης Ειδίκευσης. O φοιτητής καταρτίζει το πρόγραμμα σπουδών σε συνεργασία με τον επιβλέποντα καθηγητή, ο οποίος είναι μέλος Δ.Ε.Π. του Τμήματος. 

Κατεύθυνση Ιστορίας

1. Ειδίκευση Αρχαίας Ιστορίας

• ΙΑΕ 701 Ελληνική Επιγραφική (10 ECTS)
• ΙΑΕ 702 Ελληνική Ιστοριογραφία (10 ECTS)
• ΙΑΕ 703 Αρχαϊκή και Κλασική Εποχή (10 ECTS)
• ΙΑΕ 704 Ελληνιστική Εποχή (10 ECTS)
• ΙΑΕ 705 Μορφές και θεσμοί κοινωνικής, πολιτικής και θρησκευτικής οργάνωσης (10 ECTS)
• ΙΑΕ 706 Διακρατικές και διπλωματικές σχέσεις (10 ECTS)
• ΙΑΕ 707 Οι ελληνικές επαρχίες της ρωμαϊκής αυτοκρατορίας (10 ECTS)
• ΙΑΕ 708 Οι ελληνικές πόλεις υπό ρωμαϊκή κυριαρχία: κοινωνία και πολιτεία (10 ECTS)
• ΙΑΕ 709 Εξειδικευμένα θέματα (10 ECTS)
• ΙΡΩ 710 Λατινική Επιγραφική (10 ECTS)
• ΙΡΩ 711 Λατινική Ιστοριογραφία (10 ECTS)
• ΙΡΩ 712 Ρεπουμπλικανική περίοδος (10 ECTS)
• ΙΡΩ 713 Αυτοκρατορική περίοδος (10 ECTS)
• ΙΡΩ 714 Οι επαρχίες του ρωμαϊκού κράτους (10 ECTS)
• Δ1 Μεθοδολογία Επιστημονικής Έρευνας (10 ECTS)
• Δ2 Μεθοδολογία συγγραφής επιστημονικής εργασίας (10 ECTS)

2. Ειδίκευση Βυζαντινής και Μεσαιωνικής Ιστορίας

• ΙΒΥ 701 Πολιτική και Εκκλησιαστική Ιστορία του Βυζαντίου (10 ECTS)
• ΙΒΥ 702 Οικονομική και Κοινωνική Ιστορία του Βυζαντίου (10 ECTS)
• ΙΒΥ 703 Στρατός και βυζαντινό ναυτικό (10 ECTS)
• ΙΒΥ 704 Πηγές της Βυζαντινής Ιστορίας και Διπλωματική (10 ECTS)
• ΙΒΥ 705 Θέματα έρευνας στη Βυζαντινή Ιστορία (10 ECTS)
• ΙΒΥ 706 Αυτοκρατορική ιδεολογία, διοίκηση, θεσμοί του Βυζαντίου (10 ECTS)
• ΙΒΥ 707 Ιστορική Γεωγραφία (10 ECTS)
• ΙΜΕ 708 Θέματα Μεσαιωνικής Ιστορίας της Δύσης (10 ECTS)
• ΙΣΛ 709 Ιστορία και Πολιτισμός των νοτιοσλαβικών Λαών (10 ECTS)
• ΙΣΛ 710 Οι Σλάβοι των Βαλκανίων και της Ρωσίας ως μια πολιτισμική και ορθόδοξη ενότητα (10 ECTS)
• Δ1 Μεθοδολογία Επιστημονικής Έρευνας (10 ECTS)
• Δ2 Μεθοδολογία συγγραφής επιστημονικής εργασίας (10 ECTS)

3. Ειδίκευση Νεότερης και Σύγχρονης Ιστορίας

• ΙΝΣ 701 Θέματα Νεότερης Ελληνικής Ιστορίας. Θεσμοί, κοινωνία, οικονομία, ιδεολογικά ρεύματα (10 ECTS)
• ΙΝΣ 702 Θέματα Νεότερης Ελληνικής Ιστορίας. Πολιτική Ιστορία και διακρατικές σχέσεις (10 ECTS)
• ΙΝΣ 703 Θέματα Νεότερης Παγκόσμιας Ιστορίας. Κοινωνία, οικονομία, διεθνείς σχέσεις (10 ECTS)
• ΙΝΣ 704 Θέματα Σύγχρονης Ελληνικής Ιστορίας. Θεσμοί, κοινωνία, οικονομία, ιδεολογικά ρεύματα (10 ECTS)
• ΙΝΣ 705 Θέματα Σύγχρονης Ελληνικής Ιστορίας. Πολιτική Ιστορία και διακρατικές σχέσεις (10 ECTS)
• ΙΝΣ 706 Θέματα Σύγχρονης Παγκόσμιας Ιστορίας. Κοινωνία, οικονομία, διεθνείς σχέσεις (10 ECTS)
• Δ1 Μεθοδολογία Επιστημονικής Έρευνας (10 ECTS)
• Δ2 Μεθοδολογία συγγραφής επιστημονικής εργασίας (10 ECTS) 

4. Ειδίκευση Ιστορίας Χωρών Χερσονήσου του Αίμου και Τουρκολογίας

• ΙΑΤ 701 Θέματα Νεότερης Ιστορίας Χωρών Χερσονήσου του Αίμου. Ιδεολογικά ρεύματα, εθνικά κινήματα και προγράμματα, κοινωνία, οικονομία (10 ECTS)
• ΙΑΤ 702 Θέματα Νεότερης Ιστορίας Χωρών Χερσονήσου του Αίμου. Πολιτική ιστορία, διαβαλκανικές σχέσεις, πολιτική Μεγάλων Δυνάμεων (10 ECTS)
• ΙΑΤ 703 Θέματα Σύγχρονης Ιστορίας Χωρών Χερσονήσου του Αίμου. Πολιτική – οικονομική – κοινωνική – ιστορία, διαβαλκανικές σχέσεις, πολιτική Μεγάλων Δυνάμεων (10 ECTS)
• ΙΑΤ 704 Θεσμοί, πολιτική και ιδεολογία του οθωμανικού κράτους (10 ECTS)
• ΙΑΤ 705 Οθωμανική κοινωνία και οικονομία (10 ECTS)
• ΙΑΤ 706 Οθωμανικές πηγές (10 ECTS)
• Δ1 Μεθοδολογία Επιστημονικής Έρευνας (10 ECTS)
• Δ2 Μεθοδολογία συγγραφής επιστημονικής εργασίας (10 ECTS)  

5. Ειδίκευση Κοινωνικής Ανθρωπολογίας και Λαογραφίας 

• ΙΑΛ 701 Θεωρία και Ιστορία της Κοινωνικής Ανθρωπολογίας (10 ECTS)
• ΙΑΛ 702 Θεωρία και Ιστορία της Λαογραφίας (10 ECTS)
• ΙΑΛ 703 Θέματα Κοινωνικής Ανθρωπολογίας και Κοινωνικής Ιστορίας (10 ECTS)
• ΙΑΛ 704 Οικονομία και Τεχνολογία: Θέματα Υλικού Πολιτισμού και Κατανάλωσης (10 ECTS)
• ΙΑΛ 705 Πολιτική Ανθρωπολογία, Κοινωνική Οργάνωση (10 ECTS)
• ΙΑΛ 706 Συμβολικά Συστήματα (10 ECTS)
• ΙΑΛ 707 Ανθρωπολογία της Συγγένειας και του Φύλου (10 ECTS)
• ΙΑΛ 708 Εθνογραφία και Ανθρωπολογική Θεωρία (10 ECTS)
• Δ1 Μεθοδολογία Επιστημονικής Έρευνας (10 ECTS)
• Δ2 Μεθοδολογία συγγραφής επιστημονικής εργασίας (10 ECTS)   

Κατεύθυνση Αρχαιολογίας και Ιστορίας της Τέχνης

1. Ειδίκευση Προϊστορικής Αρχαιολογίας

• ΑΠΡ 701 Αρχαιολογική θεωρία και Μέθοδος Ι (10 ECTS)
• ΑΠΡ 702 Αρχαιολογική θεωρία και Μέθοδος ΙΙ (10 ECTS)
• ΑΠΡ 703 Νεολιθικός Πολιτισμός Ι (10 ECTS)
• ΑΠΡ 704 Νεολιθικός Πολιτισμός ΙΙ (10 ECTS)
• ΑΠΡ 705 Πολιτισμός της Εποχής του Χαλκού Ι (10 ECTS)
• ΑΠΡ 706 Πολιτισμός της Εποχής του Χαλκού ΙΙ (10 ECTS)
• ΑΠΡ 707 Ειδικά Θέματα Προϊστορικής Αρχαιολογίας Ι (10 ECTS)
• ΑΠΡ 708 Ειδικά Θέματα Προϊστορικής Αρχαιολογίας ΙΙ (10 ECTS)
• Δ1 Μεθοδολογία Επιστημονικής Έρευνας (10 ECTS)
• Δ2 Μεθοδολογία συγγραφής επιστημονικής εργασίας (10 ECTS)    

2. Ειδίκευση Κλασικής Αρχαιολογίας

• ΑΚΛ 701 Πρώιμη ιστορική και αρχαϊκή περίοδος (10 ECTS)
• ΑΚΛ 702 Κλασική περίοδος (10 ECTS)
• ΑΚΛ 703 Ελληνιστική περίοδος (10 ECTS)
• ΑΚΛ 704 Ρωμαϊκή περίοδος (10 ECTS)
• ΑΚΛ 705 Ενεπίγραφα μνημεία (10 ECTS)
• ΑΚΛ 706 Εικονογραφία και κυκλοφορία των νομισμάτων (10 ECTS)
• ΑΚΛ 707 Διαχρονική εξέταση των αρχαιολογικών μνημείων (10 ECTS)
• ΑΚΛ 708 Ο βίος των αρχαίων (10 ECTS)
• ΑΚΛ 709 Εικονογραφία και εικονολογία (10 ECTS)
• ΑΚΛ 710 Τα αρχαιολογικά μνημεία και η λειτουργία τους (10 ECTS)
• ΑΚΛ 711 Πρακτική άσκηση: Μνημεία και η προβληματική τους (10 ECTS)
• ΑΚΛ 712 Αρχαιολογικές μελέτες: Κριτική προσέγγιση (10 ECTS)
• Δ1 Μεθοδολογία Επιστημονικής Έρευνας (10 ECTS)
• Δ2 Μεθοδολογία συγγραφής επιστημονικής εργασίας (10 ECTS)   

3. Ειδίκευση Βυζαντινής Αρχαιολογίας

• ΑΒΥ 701 Ειδικά θέματα βυζαντινής Αρχαιολογίας και Τέχνης (10 ECTS)
• ΑΒΥ 702 Υλικά αντικείμενα του Βυζαντινού πολιτισμού Ι (10 ECTS)
• ΑΒΥ 703 Υλικά αντικείμενα του Βυζαντινού πολιτισμού ΙΙ (10 ECTS)
• ΑΒΥ 704 Oργάνωση και χρήση του χώρου στο Βυζάντιο Ι (10 ECTS)
• ΑΒΥ 705 Oργάνωση και χρήση του χώρου στο Βυζάντιο ΙΙ (10 ECTS)
• ΑΒΥ 706 Διάκοσμος και η θεματική του στα Βυζαντινά μνημεία Ι (10 ECTS)
• ΑΒΥ 707 Διάκοσμος και η θεματική του στα Βυζαντινά μνημεία ΙΙ (10 ECTS)
• ΑΒΥ 708 Ανάδειξη της καθημερινής ζωής στο Βυζάντιο μέσα από τις Μουσειακές Εκθέσεις (10 ECTS)
• ΑΒΥ 709 Η προβολή του Βυζαντινού Πολιτισμού σε Εκθέσεις και Μουσεία (10 ECTS)
• ΑΒΥ 710 Τεχνολογία υλικών της Βυζαντινής περιόδου (10 ECTS)
• Δ1 Μεθοδολογία Επιστημονικής Έρευνας (10 ECTS)
• Δ2 Μεθοδολογία συγγραφής επιστημονικής εργασίας (10 ECTS)    

4. Ειδίκευση Ιστορίας της Τέχνης 

• ΑΙΤ 701 Η Τέχνη της Αναγέννησης (10 ECTS)
• ΑΙΤ 702 Ευρωπαϊκή Τέχνη του 17ου και 18ου αιώνα (10 ECTS)
• ΑΙΤ 703 Ευρωπαϊκή Τέχνη του 19 ου Αιώνα (10 ECTS)
• ΑΙΤ 704 Η Τέχνη από το 1900 ως το Β´ Παγκόσμιο πόλεμο (10 ECTS)
• ΑΙΤ 705 Ελληνική Τέχνη του 19ου αιώνα (10 ECTS)
• ΑΙΤ 706 Ελληνική Τέχνη του 20ού αιώνα (10 ECTS)
• ΑΙΤ 707 Ζητήματα Σύγχρονης Τέχνης (10 ECTS)
• ΑΙΤ 708 Ζητήματα Θεωρίας και Ιστορίας της Τέχνης (10 ECTS)
• Δ1 Μεθοδολογία Επιστημονικής Έρευνας (10 ECTS)
• Δ2 Μεθοδολογία συγγραφής επιστημονικής εργασίας (10 ECTS)   

5. Ειδίκευση μελέτης και διαχείρισης αρχαιολογικού υλικού (μη προσφερόμενη)

• ΜΕΔ 701 Πολιτισμός και διαχείριση των πολιτισμικών υλικών του παρελθόντος (10 ECTS)
• ΜΕΔ 702 Τεχνολογία και διατροφή (10 ECTS)
• ΜΕΔ 703 Διαχείριση και ανάδειξη αρχαιολογικών χώρων και μουσειολογία (10 ECTS)
• ΜΕΔ 704 Μέθοδοι και τεχνικές ανάλυσης της τεχνολογίας του πηλού, του λίθου και των μετάλλων 
• ΜΕΔ 704 Μέθοδοι και τεχνικές ψηφιακής τεκμηρίωσης και ανάλυσης αρχαιολογικών πληροφοριών (10 ECTS)
• ΜΕΔ 704 Μέθοδοι και τεχνικές ανάλυσης του ανθρωπογενούς αρχαίου περιβάλλοντος. Τα οργανικά κατάλοιπα (10 ECTS)
• Δ1 Μεθοδολογία Επιστημονικής Έρευνας (10 ECTS)
• Δ2 Μεθοδολογία συγγραφής επιστημονικής εργασίας (10 ECTS)