Το Δ.Π.Μ.Σ. (EMJM  MorphoPHEN) διαρθρώνεται σε δύο (2) εξάμηνα.

Στο Α’ εξάμηνο (Σύνολο ECTS 30) διδάσκονται δυο διδακτικές ενότητες σε δύο (2) διαφορετικά Πανεπιστημιακά Ιδρύματα. Η 1η Διδακτική Ενότητα (ECTS: 10) διεξάγεται στο Τμήμα Κτηνιατρικής του Αυτόνομου Πανεπιστημίου της Βαρκελώνης και περιλαμβάνει 12 μαθήματα (11 υποχρεωτικά και ένα επιλογής), ενώ η 2η Διδακτική Ενότητα στο Τμήμα Κτηνιατρικής & Ζωικής Παραγωγής του Πανεπιστημίου της Νάπολης Federico II και περιλαμβάνει επτά μαθήματα (έξι υποχρεωτικά και  ένα επιλογής).

Στο Β’ εξάμηνο (Σύνολο ECTS 30) διδάσκεται η 3η Διδακτική Ενότητα (ECTS: 20) που διεξάγεται στο Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών & Μηχανικών Υπολογιστών του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης και περιλαμβάνει  οχτώ μαθήματα (επτά υποχρεωτικά και ένα επιλογής). Θα διδάσκονται επίσης μαθήματα Σχεδιασμού των Πειραματισμών (Experimental Design). Επίσης εκπονείται και η μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία (ECTS: 10) σε ένα από τα Πανεπιστήμια της επιλογής της/του υποψηφίου μεταξύ των UAB,UNINA, AUTH και FMV-ULisboa.

Τη Διεύθυνση του Προγράμματος την έχει η Αναπληρώτρια Καθηγήτρια του Τμήματος Κτηνηιατρικής του ΑΠΘ, κ. Τσιγκοτζίδου Αναστασία.

Η επίσημη γλώσσα διεξαγωγής του προγράμματος είναι η αγγλική οπότε και η γλώσσα εκπόνησης της μεταπτυχιακής εργασίας είναι αποκλειστικά η αγγλική.

A’ εξάμηνο (Σύνολο ECTS 30)
(Δύο υποχρεωτικές διδακτικές ενότητες)
Αυτόνομο Πανεπιστήμιο της Βαρκελώνης (Universitat Autónoma de Barcelona, UAB) Τμήμα Κτηνιατρικής

1η Διδακτική Ενότητα (module)
Mouse status in biomedicine

• Standardized nomenclature for mice
• Anatomical and histological methods
• Mouse embryology and placenta
• Gross anatomy and topography in mouse
• Histology of mouse organs
• Ultrastructure of mouse tissues
• Ontological approach to mouse morphology
• Introduction to general mouse pathology
• Mouse necropsy
• Pathology of the major organ systems
• Optional language (Spanish, Catalan)

2η Διδακτική Ενότητα
Mouse Imaging
Πανεπιστήμιο της Νάπολης (Università degli Studi di Napoli Federico II, UNINA) Τμήμα Κτηνιατρικής & Ζωικής Παραγωγής και Ινστιτούτο Δομής και Απεικόνισης στις Βιοϊατρικές Επιστήμες

• Anatomical bases of mouse imaging
• Mouse handling, care, and anaesthesia
• Imaging using ionizing radiation (X-ray, CT, SPECT, PET)
• Imaging using non-ionizing radiation (MRI, FMT, NIR, HFUS, PAI)
• Hybrid imaging (PET/CT, PET/MR, US/PAI)
• Applications: cell trafficking and cell tissue homing, angiogenesis, hypoxia, apoptosis and inflammation
• Optional language course (Italian)

Β ΄ εξάμηνο (Σύνολο ECTS 30)
(Μια υποχρεωτική διδακτική ενότητα & Διπλωματική Εργασία)
3η Διδακτική Ενότητα Deep Learning & Experimental Design
Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης (Α.Π.Θ.) Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών & Μηχανικών Υπολογιστών

• Introduction to deep and machine learning
• Classifiers and metrics for evaluation
• Supervised and unsupervised algorithms
• Convolutional neural and recurrent networks
• Methodologies for 1D and 2D signals: sliding windows, super-pixels, streaming data and whole pictures transformation
• Methodologies for conducting deep learning experiments
• Experimental design with mouse: quantitative comparison, ARRIVE and 3Rs
• Optional language course (Greek) y 3Rs

    
Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία
Πανεπιστήμιο Διεξαγωγής
Επιλογή του υποψηφίου μεταξύ των:
Πανεπιστήμιο της Λισαβόνας, Κτηνιατρική Σχολή  (Faculdade de Medicina Veterinária da Universidade de Lisboa , FMV-ULisboa) Τμήμα Ανατομίας & Φυσιολογίας Ζώων, ή Α.Π.Θ ή UNINA ή UAB