Mε απόφαση του Υπουργού Παιδείας καθορίσθηκε ο αριθμός των παρεχομένων θέσεων για φοιτητές μεταπτυχιακών προγραμμάτων του ΕΑΠ,  για το ακαδημαϊκό έτος 2015−2016 στις 5.210,  οι οποίες κατανέμονται ανά Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα  Σπουδών(Π.Μ.Σ.) ως ακολούθως :

Α. Σχολή Ανθρωπιστικών Σπουδών

• Εκπαίδευση Ενηλίκων (215)
• Μεταπτυχιακή Ειδίκευση Καθηγητών Αγγλικής Γλώσσας (120)
• Μεταπτυχιακή Ειδίκευση Καθηγητών Γαλλικής Γλώσσας (70)
• Μεταπτυχιακή Ειδίκευση Καθηγητών Γερμανικής Γλώσσας  (45)
• Σπουδές στην Εκπαίδευση (700)
• Σπουδές στην Ορθόδοξη Θεολογία (90)

Β. Σχολή Θετικών Επιστημών και Τεχνολογίας

• Διασφάλιση Ποιότητας (370)
• Διαχείριση Αποβλήτων (280)
• Διαχείριση Τεχνικών Έργων (320)  
• Κατάλυση και Προστασία του Περιβάλλοντος (45)
• Μεταπτυχιακές Σπουδές στα Μαθηματικά (90)
• Μεταπτυχιακή Ειδίκευση Καθηγητών Φυσικών Επιστημών (60) –
• Μεταπτυχιακή Εξειδίκευση στα Πληροφοριακά Συστήματα (100)
• Περιβαλλοντικός Σχεδιασμός έργων Υποδομής (120)
• Περιβαλλοντικός Σχεδιασμός Πόλεων και Κτιρίων (140)
• Προχωρημένες Σπουδές στη Φυσική (30)
• Σεισμική Μηχανική και Αντισεισμικές Κατασκευές (85) –
• Τεχνολογία Υλικού και Λογισμικού(90)

Γ. Σχολή Κοινωνικών Επιστημών

• ΚΟΙΝΟ Π.Μ.Σ. Διοίκηση Επιχειρήσεων ΜΒΑ (450)
• Διοίκηση Μονάδων Υγείας (395)
• Διοίκηση Πολιτισμικών Μονάδων (400)
• Διοίκηση Τουριστικών Επιχειρήσεων (390)
• Τραπεζική (455)

Δ. Σχολή Εφαρμοσμένων Τεχνών

• Γραφικές Τέχνες − Πολυμέσα (60)
• Σχεδιασμός Φωτισμού − Πολυμέσα (60)
• Ακουστικός Σχεδιασμός και Πολυμέσα (30)

521 θέσεις (ποσοστό 10%) επιπλέον των ανωτέρω 5.210 θέσεων μεταπτυχιακών φοιτητών θα διατεθούν για μέλη του εκπαιδευτικού προσωπικού των ΤΕΙ που δεν κατέχουν μεταπτυχιακό τίτλο σπουδών (ΜΔΕ). Οι θέσεις αυτές κατανέμονται αναλογικά στα Π.Μ.Σ. με απόφαση της Δ.Ε.