Στο πλαίσιο του ΠΜΣ προσφέρονται τα εξής μαθήματα (ενδεικτικός κατάλογος μαθημάτων και στις δύο Κατευθύνσεις)

• Διεθνείς Θεσμοί και Ασφάλεια
• Διεθνής Θεωρία και Παγκόσμια Διακυβέρνηση
• Ευρωπαϊκή Διακυβέρνηση
• Παγκόσμια Οικονομική Διακυβέρνηση
• Ευρωπαϊκή Ενοποίηση και Οικονομική Ολοκλήρωση
• Ευρωπαϊκή Ολοκλήρωση και Εγχώρια Πολιτική: Η περίπτωση της Ελλάδας
• Οικονομικές Κρίσεις και Διεθνές Σύστημα
• Ασφάλεια: Σύγχρονες Προσεγγίσεις και Διερευνήσεις
• Κλιματική Κρίση και Ασφάλεια
• Ευρωπαϊκή Ασφάλεια
• Νέες Απειλές και Προκλήσεις Ασφάλειας/ Τεχνολογία και Ασφάλεια
• Μετανάστευση: Ζητήματα Διακυβέρνησης και Ασφάλειας
• Ανατολική Μεσόγειος και Μέση Ανατολή
• Πολιτιστική Διακυβέρνηση και Ασφάλεια
• Γεωπολιτική της Ενέργειας
• Παγκοσμιοποίηση, Μορφές Ηγεμονίας και Πολιτικές Στρατηγικές
• Θεωρία και Διακυβέρνηση Ομοσπονδιακών συστημάτων
• Έννομη τάξη της ΕΕ