Κατά τη διάρκεια των σπουδών οι μεταπτυχιακοί φοιτητές υποχρεούνται α) σε παρακολούθηση 9 μαθημάτων που θα συμπληρώνουν 90 ECTS και β) εκπόνηση διπλωματικής εργασίας (30 ECTS). Συνολικά απονέμονται 120 ECTS.

Τα μαθήματα του προγράμματος είναι τα ακόλουθα:

A΄ Εξάμηνο (30 ECTS)

1. Οργάνωση − διοίκηση εκπαιδευτικών μονάδων (10 ECTS)
2. Εκπαιδευτική πολιτική, καινοτομία και αλλαγή στην εκπαίδευση (10 ECTS)
3. Μεθοδολογία έρευνας (10 ECTS)

Β΄ Εξάμηνο (30 ECTS)

4. Τεχνολογία και καινοτόμες εφαρμογές στην εκπαίδευση (10 ECTS)
5. Διοίκηση ολικής ποιότητας σε εκπαιδευτικούς οργανισμούς (10 ECTS)
6. Διαπροσωπικές σχέσεις, αλληλεπίδραση και καινοτόμες εφαρμογές στο εκπαιδευτικό περιβάλλον (10 ECTS)

Γ΄ Εξάμηνο (30 ECTS) 

7. Οικονομικά της εκπαίδευσης (10 ECTS)
8. Ευρωπαϊκοί εκπαιδευτικοί θεσμοί (10 ECTS)
9. Ηγεσία−ειδικά θέματα οργανωσιακής συμπεριφοράς (10 ECTS)

Δ΄ Εξάμηνο (30 ECTS) 
Συγγραφή μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας (30 ECTS)